Little Farm Clicker ist ein halbleichtes, inkrementelles Spiel mit dem Thema Farmmanagement. Ein Stadtmädchen und ihre beiden Freunde haben sich bereit erklärt, dem pensionierten Großvater des Mädchens bei der Bewirtschaftung seines Bauernhofs zu helfen. Sie müssen Feldfrüchte anbauen und ernten und einige Grundstücke für die Viehzucht nutzen. Der Spieler hilft ihnen dabei, indem er durch Klicken oder Tippen die Produktion beschleunigt und die Einnahmen einsammelt. Er kann auch schneller vorankommen, indem er mit einer einzigen Wischbewegung über mehrere Grundstücke fährt.
Der Spieler verwendet die Einnahmen, um zusätzliche Pflanzen und Tiere zu kaufen und schließlich bis zu neun Grundstücke zwischen dem Haupthaus und der Scheune zu eröffnen. Zu Beginn muss er sich um Weizen und Hühner kümmern. Im Laufe der Zeit können sie Kühe, Mais und eine Vielzahl anderer Optionen erwerben. Sie können auch andere Arten von Währung einsetzen, darunter blaue Kristalle und Saatgut, um eine Vielzahl von Aufgaben zu erfüllen. Sie können Prozesse automatisieren, die Effizienz des Saatguts erhöhen, Gewinnmultiplikatoren erwerben und sogar eine Zeitmaschine benutzen, um die Einnahmen schneller zu verdienen, indem sie ein paar Tage überspringen.
Little Farm Clicker belohnt den Spieler auch mit geheimnisvollen Kisten, die er öffnen kann, nachdem er das neunte Grundstück freigeschaltet hat. Das Spiel bietet Missionen für jeden der Freunde. Der Spieler kann einen Charakter aufleveln und blaue Kristalle und andere Vorteile erhalten, wenn er Aufgaben erfüllt. Hin und wieder gibt es auch kostenlose Tools, wie z.B. einen Sprinkler, der den Verdienst für vier Stunden verdoppelt.
Der Spieler verdient auch unterwegs weiter, solange er den Cache seines Browsers nicht löscht. Er kann seinen Verdienst erhöhen, indem er sich Werbung ansieht.