I Wonder Crash Clicker er du på en mission for at ødelægge alle verdens vidundere, såsom pyramider, hængende haver og meget mere. Det gør du ved at lade en strøm af projektilblokke regne ned, som ødelægger de blokke, der udgør de forskellige strukturer, som du angriber. Du starter med at angribe huse og landsbyer for at opbygge dine point, og derefter bruger du dine point til at købe opgraderede angreb. Angrebene er som følger:
Gul - Dit standardangreb
Rød - Lille, men hurtigt angreb
Lilla - Eksplosivt angreb
Grønt - Splintangreb
Turkis - Hoppende angreb
Rødt - Lodret linjeangreb
Gråt - Vandret linjeangreb
Mange af disse angreb vil ske med jævne mellemrum, men du kan fremskynde dit grundlæggende gule angreb ved at klikke på skærmen. Dette giver dig også mulighed for at sigte det.
Når du ødelægger nok blokke, får du mulighed for at lave en Wonder Trial. I denne prøve skal du ødelægge et vidunder af verden inden for en bestemt tidsgrænse. Der er ingen straf for at tabe, så tøv ikke med at give det et forsøg, hvis du tror, du kan vinde. Når du ødelægger et vidunder, får du en særlig valuta kaldet "talenter". Brug talenterne til at låse op for bonusfunktioner som f.eks. øget angrebskraft og længere tid til at ødelægge vidundere.