Little Farm Clicker er et semi-idle inkrementelt spil med et farm-management-tema. En bypige og hendes to venner har aftalt at hjælpe pigens pensionerede bedstefar med at passe hans gård. De skal plante og høste afgrøder og bruge nogle marker til husdyr. Spilleren hjælper dem ved at fremskynde produktionen og indsamle indtægter ved at klikke eller trykke. De kan også gå hurtigere ved at bruge en enkelt swipe-bevægelse på tværs af flere grunde.
Spilleren bruger indtægterne til at købe yderligere planter og dyr og til sidst åbne op til ni grunde mellem hovedhuset og laden. I starten skal de håndtere hvede og kyllinger. De kan udvide til køer, majs og en række andre muligheder over tid. De kan også bruge andre typer valuta, herunder blå krystaller og frø, til at udføre en bred vifte af opgaver. De kan automatisere processer, øge frøenes effektivitet, få indtjeningsmultiplikatorer og endda bruge en tidsmaskine til at tjene penge hurtigere ved at springe et par dage frem i tiden.
Little Farm Clicker belønner også spilleren med mystiske kasser, som de kan åbne, når de har låst op for det niende plot. Spillet indeholder missioner for hver af vennerne. Spilleren kan opgradere en figur og modtage blå krystaller og andre fordele, når han eller hun løser opgaver. Nu og da giver spillet dem også gratis værktøjer, såsom en sprinkler, der fordobler deres indtjening i fire timer.
Spilleren fortsætter med at tjene, mens de er væk, så længe de ikke rydder deres browsers cache. De kan øge deres indtjening ved at se reklamer.