Capybara Clicker, et trinvis tomgangsspil, giver spilleren mulighed for at kombinere den populære clicker action med bedårende capybaras. Spillerens eneste mål er at få capybaras til at formere sig til et højt antal på over quadrillioner. Spilleren kan også opgradere hovedcapibarens hud og vejret.
Spilleren starter med en normal capybara på en solskinsdag. De skal generere et bestemt antal capybaras for at øge produktionen pr. sekund og pr. klik. Når de når bestemte niveauer, låses skind op og opdateres automatisk på skærmen. Populære skins omfatter Witch Capybara, King Capybara, Pixelated Capybara, Wizard Capybara og Galactic Capybara. Vejret opdateres også automatisk fra sol til regn, stjerneregn, blæst og sne. Når disse områder er låst op, kan spilleren skifte til den indstilling, han/hun bedst kan lide, eller beholde den opdaterede indstilling.
Capybara Clicker er for det meste tomgang, når spilleren når et vist punkt, fordi han/hun kan indstille klikstyrke via en autoclicker i spillet og andre værktøjer, der mangedobler capybaraen i et stadigt stigende antal og tempo. Dette giver også deres hardware en pause. Spilleren køber værktøjer med capybara-point. Spillet forsyner dem også med gratis offlineindtægter, en 2X per klik-multiplikator, når de fylder måleren nær nederste venstre hjørne af skærmen og efter at de har set reklamer. Til sidst når de et opstigningspunkt og starter forfra med en permanent, utrolig høj multiplikator.
Tilfredsstillende musik spiller under produktionsprocessen for at gøre hele oplevelsen mere afslappende!