Wheely 3 gaat verder met de zoektocht van de speler om de antropomorfe auto Wheely te helpen succesvol door zijn wereld te navigeren. In dit deel heeft Wheely`s geliefde Jolie een nieuw wiel nodig. De speler laat Wheely verschillende opdrachten uitvoeren om een wiel voor haar te kopen. Net als in de vorige twee delen moet de speler zijn gezond verstand gebruiken, redeneren vanuit deductie, op wetenschap gebaseerde vaardigheden en een verscheidenheid aan hulpmiddelen om puzzels op te lossen, om te gaan met zowel niet-bedreigende als bedreigende voertuigen en elk level van het spel te voltooien.
