Agent Walker vs. Skibidi Toilets is een driedimensionale third-person shooter die de speler in dodelijke situaties plaatst in 10 levels van de geanimeerde Skibidi Toilet wereld. Als cameraman in een wit camerapak in een robotachtige mechwalker met vier ledematen bestrijdt de speler Skibidi Toilet-monsters met vier van de maximaal zes beschikbare wapens tegelijk, waaronder een afgezaagd jachtgeweer, een raketwerper, een katana-achtig zwaard en een gemotoriseerd handheld Gatling-geweer.
De speler vecht aanvankelijk tegen basistoiletten van Skibidi. Uiteindelijk vechten ze tegen spinnen- en vijfkoppige Skibidi-varianten en tegen de Toilet G-Man op eindbaasniveau. Tijdens elk gevecht kan de speler de gezondheidsmeter van zijn avatar linksboven in de gaten houden en het aantal verzamelde munten eronder. Je kunt ook de bewegingen van de Skibidi-toiletten volgen via een mini-kaart in de rechterbovenhoek.
In Agent Walker vs. Skibidi Toilets kan de speler 14 upgrades maken voor de gezondheid van de agent en zijn vermogen om munten aan te trekken. Ze kunnen ook zijn hoofd upgraden naar verschillende soorten camera`s, arcadespellen, speakers en andere elektronica, evenals een aantal niet-tech items zoals een trofee. Als de speler zijn munten wil verdubbelen, moet hij een advertentie bekijken.
