Merge Fruit Time ist ein Fusionsspiel ähnlich wie 2048 und Suika Game. Der Spieler lässt fröhliche anthropomorphe Fruchtfiguren in einen ummauerten Bereich mit grauem und schwarzem Hintergrund fallen, um identische Teile so lange wie möglich zu größeren Teilen zu verschmelzen. Dabei sammelt er auch Punkte, die er in der oberen Mitte des Bildschirms verfolgen kann.
Die Fruchtoptionen beginnen mit der Erdbeere als kleinster Frucht und reichen bis zu Zitronen, Orangen, Äpfeln, Weintrauben, Ananas, Melonen und Wassermelonen. Der Spieler kann zwei Erdbeeren zu einer Zitrone, zwei Zitronen zu einer Orange oder zwei Äpfel zu einer Traube zusammenfügen. Das Spiel gibt ihm eine Vorschau auf die nächste Frucht in einem Kasten unter der Pausentaste in der oberen rechten Ecke des Bildschirms.
Merge Fruit Time fordert den Spieler heraus, indem es die Teile realistisch fallen lässt. Eine Frucht kann an Oberflächen abprallen. Sie kann rutschen oder rollen. Um eine Frucht mit größerer Genauigkeit fallen zu lassen, bietet das Spiel doppelte, weiße Ziellinien.
Das Spiel hilft dem Spieler, indem es ihm erlaubt, einen Level-Up-Stern zu verdienen, der automatisch die nächstgrößere Frucht erzeugt, wenn der Stern auf eine Frucht fällt, die er normalerweise zusammenfügen müsste. Es bietet auch Bomben, um unerwünschte Früchte zu entfernen, aber der Spieler muss Werbung sehen, um diese Werkzeuge zu benutzen.
