Polar Bear Merge ist ein Blasenschießspiel, das Verbinden und Zusammenfügen von Spielsteinen kombiniert. Ein Eisbär auf einer Eisscholle braucht die Hilfe des Spielers, um Reihen von hängenden Eiskugeln zu entfernen, bevor die Kugeln den Bildschirm hinunterrutschen, vorbei an einer horizontalen Zeitleiste über seinem Kopf.
Der Spieler kann keine 3-Gewinnt-Mechanik wie bei anderen Bubble Shootern anwenden. Stattdessen muss er den Bären anweisen, mit Zahlen versehene Kugeln auf eine oder mehrere passende Kugeln zu werfen, damit sich diese miteinander verbinden. Die verbundenen Kugeln verschmelzen nach oben zum Ende der Verbindung hin. Bälle unter den verbundenen Bällen fallen auf die Zeitlinie und brechen ab, um Punkte zu verteilen.
Der Eisbär wirft vor allem Eiskugeln, die mit 1, 2 und 3 gekennzeichnet sind. Wenn diese Kugeln auf passende Kugeln treffen, bilden die verbundenen Kugeln eine Kugel mit der nächsthöheren Zahl. Trifft zum Beispiel eine 2 eine oder mehrere 2-Kugeln, verschmelzen alle verbundenen 2-Kugeln zu einer einzigen 3-Kugel. Wenn die Kugel neben einer oder mehreren 3er-Kugeln liegt, verschmelzen die Kugeln zu einer einzigen 4er-Kugel.
Polar Bear Merge belohnt den Spieler mit Punkten und Münzen. Mit den Münzen kann der Spieler verschiedene Farben und Formen von Eis kaufen. Wenn er bereit ist, sich eine Werbung anzusehen, kann er seine Münzen verdoppeln.
Das Spiel bietet dem Spieler auch einen Raketen-Booster und einen 10-Sekunden-Stop-Time-Booster. Allerdings muss der Spieler Werbung sehen, um diese hilfreichen Tools zu nutzen.
