Bubble Cats Story ist ein Spiel, in dem Blasen geplatzt werden, und bietet Katzenabenteuer und ein Tierrettungsthema. Die anthropomorphen Katzen Berry, Belle, Ziggy, Smokey und Rita brauchen die Hilfe des Spielers in Hunderten von Levels. Der Spieler lässt Blasen mit Wurfgeschossen platzen, um Aufgaben zu erfüllen, wie z.B. die Rettung von Kätzchen in Seifenblasen, nachdem sie von einer bösen Krake entführt wurden, oder die Fütterung erwachsener Katzen mit speziellen Keksen, die in Blasen eingeschlossen sind.
Der Spieler kann nur Gruppen von drei oder mehr identischen Blasen zerplatzen lassen. Anstelle eines traditionellen Shooters steuert er eine Spielfigur, um Projektilblasen zu benutzen, die sich in einer Kiste auf einem Luftschiff befinden, mit dem die Katzen von Level zu Level fliegen.
Das Spiel bietet dem Spieler mehrere Methoden, um ein Level schneller zu bewältigen. Er kann mit einer gepunkteten Ziellinie präzisere Schüsse abgeben. Er kann die Blasengeschosse wechseln. Außerdem kann er mit Hilfe anderer Charaktere auf Power-Ups und Booster zugreifen. Sie können zum Beispiel einen der anderen Charaktere mit genügend Keksen füttern, damit dieser eine spezielle Fähigkeit erhält und einen Booster erzeugt, der eine große Anzahl von gemischten Blasen zum Platzen bringt.
Bubble Cats Story belohnt den Spieler mit Punkten, Sternen und Münzen. Der Spieler behält den Überblick über seinen Punktestand in der oberen linken Ecke. Die meisten Punkte erhält er, wenn er extrem große Cluster zum Platzen bringt und Kombinationsbewegungen ausführt, bei denen er erfolgreich mehrere Cluster hintereinander trifft und zum Platzen bringt, ohne sie zu verfehlen.
