The Mystery Mansion är ett mysteriespel med dolda föremål där spelarens främsta uppgift är att hjälpa huvudpersonen Annie att avslöja sin familjs hemligheter efter att hon ärvt en gammal herrgård av sin moster Elizabeth. För att låsa upp varje nivå i spelet måste spelaren hitta en mängd dolda föremål i olika, röriga, utomhusområden och inomhusrum. Varje scen visar en statisk bakgrund med utspridda föremål överallt. Spelet presenterar föremål som spelaren måste hitta i fem guldinramade, lila lådor längst ner i mitten av skärmen. Föremålen i rummen stämmer inte överens med verkliga storlekar eller former. Spelaren kan hitta dem miniatyriserade, överdimensionerade, gömda bakom andra föremål, i sidled eller upp och ner. Under spelets gång får spelaren mynt för sina ansträngningar som han eller hon kan använda för att betala för ledtrådar och ytterligare tid. De får också upp till tre guldstjärnor, dubbla stjärnor och stjärnor för prestationer.
