Peggle Online är ett bubbelspel med bollar i pachinko-stil istället för rader av hängande bubblor. Mot unika fantasibakgrunder försöker spelaren ta bort alla röda bollar och staplar i en nivå med metallkulor som skjuts från en kanon. De försöker också att få högsta möjliga poäng.
Spelaren riktar kanonen som finns längst upp i mitten av skärmen med en prickad mållinje och skjuter sedan en liten, medelstor eller stor metallkula ner i ett spelplan med bollar och staplar i olika färger. När deras projektil träffar en boll eller stapel ger den senare poäng eller andra belöningar, ändrar utseende och försvinner sedan från fältet.
Spelet visar antalet tillgängliga bollar per nivå i en bollräknare på vänster sida. Varje gång en boll faller ner i en rörlig kopp som glider till vänster och höger över spelplanens botten kan spelaren återanvända bollen. Annars har man bara tio chanser att ta bort varje röd boll eller stapel. Om de träffar andra föremål som har olika färger får de multiplikatorer och andra belöningar. Om man till exempel träffar en rosa boll eller stapel får man två gånger så många poäng. Om de träffar en grön boll får de en större, uppladdad boll. Spelet spårar multiplikatorer med en mätare på höger sida av skärmen.
Peggle: Bubble Evolution ger spelaren extra bollar om de tar slut och de är villiga att titta på en annons. Varje gång de vinner ett spel får de också upp till tre guldmynt präglade med stjärnor.
