Little Farm Clicker är ett halvdant inkrementellt spel med bondgårdstema. En stadsflicka och hennes två vänner har kommit överens om att hjälpa flickans pensionerade farfar att sköta sin gård. De måste plantera och skörda grödor och använda vissa tomter för boskap. Spelaren hjälper dem genom att påskynda produktionen och samla in intäkter med hjälp av klick- eller knackrörelser. De kan också gå snabbare genom att använda en enda svepande rörelse över flera tomter.
Spelaren använder intäkterna för att köpa ytterligare växter och djur och så småningom öppna upp till nio tomter mellan huvudbyggnaden och ladan. Inledningsvis måste de hantera vete och kycklingar. De kan expandera till kor, majs och en mängd andra alternativ över tiden. De kan också använda andra typer av valuta, inklusive blå kristaller och frön, för att utföra ett brett spektrum av uppgifter. De kan automatisera processer, öka utsädeffektiviteten, förvärva vinstmultiplikatorer och till och med använda en tidsmaskin för att tjäna intäkterna snabbare genom att hoppa över några dagar framåt.
Little Farm Clicker belönar också spelaren med mysterielådor som de kan öppna efter att de har låst upp den nionde tomten. Spelet har uppdrag för var och en av vännerna. Spelaren kan nivåera upp en karaktär och få blå kristaller och andra fördelar när de slutför uppgifter. Då och då ger spelet dem också gratisverktyg, till exempel en sprinkler som fördubblar deras intäkter under fyra timmar.
Spelaren fortsätter att tjäna medan han är borta, så länge han inte rensar webbläsarens cache. De kan öka sina intäkter genom att titta på annonser.