Bird Sort Puzzle är ett sorteringsspel med fåglar och grenar i stället för bollar och provrör. Spelaren får se blandade grupper av färgglada fåglar, bland annat cockatiels, papegojor och tukaner, som vilar på grenar i en bergig tropisk miljö. Spelaren måste ordna fåglarna efter typ med endast en typ per gren. Spelet har hundratals nivåer som utmanar spelaren med komplicerade fågelarrangemang.
Som i bollsorteringsspel väljer och flyttar spelaren fåglarna för att skapa matchade grupper. De kan flytta en fågel eller flera av samma typ som vilar bredvid varandra på en gren. Om spelaren får slut på utrymme för att flytta runt fåglarna måste han/hon starta om nivån eller försöka använda flera verktyg som spelet tillhandahåller för att hjälpa honom/hon att vinna, bland annat en bakåtpil som fungerar som en ångra-knapp och ett grenverktyg med ett plustecken som ger honom/hon en extra tom gren.
Bird Sort Puzzle erbjuder också ett tipsverktyg markerat med en glödlampa som spelaren kan använda innan han/hon får slut på rörelser. När spelaren lyckas skapa alla grupper flyger fåglarna iväg i olika riktningar i sina grupper.
