Zoom-Be 3, de derde dungeon-crawl platformgame in de Zoom-Be serie, begint met de jongens die eindelijk binnen zijn in het hoofdkwartier van de kwaadaardige organisatie. Ze hebben het sterke gevoel dat ze de controlekamer moeten bereiken om meer te weten te komen over het project dat hen voor altijd heeft veranderd. Het doel van de speler is om hen te helpen zoeken van gebouw naar gebouw in 20 levels naar het hoofdgebouw waar de kamer zich bevindt. Als ze goed presteren, bereiken de personages de kamer en vindt er een verbazingwekkende gebeurtenis plaats. De speler ontgrendelt ook een speciaal bonuslevel met sterren.
De speler of spelers kunnen de zombievrienden dezelfde handelingen laten uitvoeren als in het vorige spel, zoals deuren openen en op knoppen drukken. De grotere vriend schopt vooral tegen dingen om obstakels te verwijderen, terwijl de kleinere vriend laag hurkt, hoog springt en snel beweegt. In dit deel staan de twee vrienden voor nieuwe uitdagingen. Ze moeten bijvoorbeeld verschillende gekleurde sleutelkaarten vinden om elektronische deursloten te ontgrendelen.
Zoom-Be 3 biedt net als de vorige game een uitdaging om hoofddeksels te verzamelen. De speler of spelers kunnen een paar dierenmaskers, diervormige hoeden, cowboyhoeden, gehoornde helmen, brillen en zelfs voorwerpen die typisch zijn voor inbrekers of dieven verzamelen.