Funny Bone Surgery is een carrière-simulatie makeover spel. De speler moet een klein meisje behandelen dat ernstige verwondingen heeft opgelopen nadat ze was afgeleid tijdens het rijden op haar skateboard en tegen een harde metalen bumper op de achterkant van een geparkeerde auto botste.
De speler voert behandelingen uit die gebruikelijk zijn bij spoedeisende hulp en spoedeisende hulp. Hoewel het spel veel van de hulpmiddelen biedt die medisch personeel in een vergelijkbare situatie zou kunnen gebruiken, bevat het ook onrealistische aspecten die het voor jongere spelers gemakkelijker maken om ingewikkelde behandelingen te begrijpen. Zo voert de speler uiterst elementaire medische handelingen uit waarbij begrippen als verdoving en röntgenfoto`s worden geïntroduceerd. Ook genezen ze wonden vrijwel onmiddellijk en doden ze antropomorfe ziektekiemen met een scherp voorwerp.
Als de speler alle medische taken heeft voltooid, krijgt hij de kans om een make-over uit te voeren. Ze kunnen de kleur, stijl en lengte van het haar van het meisje veranderen. Ze kunnen haar kleding, mitella, schoen, gips of laars en wandelstok bijwerken. Ze kunnen ook handmatig decoratieve accessoires aan haar gezicht toevoegen. Het spel biedt echter een randomizer-knop met vraagtekens op een dobbelsteen die automatisch items selecteert.
Funny Bone Surgery beloont de speler telkens als hij een bepaalde taak voltooit. De speler krijgt bijvoorbeeld erkenning voor het opruimen van al het vuil, het voor het eerst gebruiken van medische instrumenten, het genezen van gekneusde ogen, het elimineren van ziektekiemen, het afmaken van alle puzzels en het uitproberen van alle verkleeditems en accessoires.
