Balloon Match 3D is een match-3 spel met een ballonthema. Het enige doel van de speler is om elk speelveld vrij te maken van zwevende ballonnen die aan een cadeau vastzitten. De speler kan op elk moment tot zeven ballonnen verwijderen door ze naar zeven lege bubbelvelden onderaan het speelveld te sturen. Ze moeten hun selecties wel zo coördineren dat ze de belvelden nooit helemaal vullen en geen zetten meer hebben.
In het spel mogen alleen drie ballonnen (in het spel tegels genoemd) met dezelfde eigenschappen in de belopen ruimtes terechtkomen. Wanneer de speler ballonnen selecteert, moet hij proberen er drie van dezelfde kleur achter elkaar te selecteren om open plekken te behouden.
Als de speler alle ballonnen verwijdert, kent het spel sterren toe als punten en een bonus van sterren op basis van vermenigvuldigers voor opeenvolgende verwijderingen en de resterende tijd op een aftelklok. Na een bepaalde speelduur beloont het spel de speler ook met schatten in een kist en nieuwe tegelontwerpen, zoals ballonnen met lachende gezichten en vlaggen van landen.
Balloon Match 3D helpt de speler de juiste selecties te maken en ballonnen op verschillende manieren te laten knappen. Geselecteerde ballonnen worden groen omlijnd. Er zijn vijf gereedschappen beschikbaar onder de bubbelvelden, waaronder een gele gloeilamp waarmee drie overeenkomende ballonnen automatisch worden verwijderd en een pijl terug waarmee de laatste beweging wordt teruggedraaid.
De speler kan de ballonnen ook draaien om sneller overeenkomsten te vinden en boosters gebruiken om ballonnen te vernietigen. Als ze falen, kunnen ze ook verdiende munten gebruiken of advertenties bekijken om verder te gaan in plaats van opnieuw te beginnen.
