Wheely 3 setzt die Aufgabe des Spielers fort, dem anthropomorphen Auto Wheely zu helfen, sich erfolgreich in seiner Welt zu bewegen. In dieser Folge braucht Wheelys Liebe Jolie ein neues Rad. Der Spieler weist Wheely an, verschiedene Aufgaben zu erfüllen, um ein Rad für sie zu beschaffen. Wie in den beiden Vorgängern muss der Spieler seinen gesunden Menschenverstand, schlussfolgerndes Denken, naturwissenschaftliche Fähigkeiten und eine Vielzahl von Werkzeugen einsetzen, um Rätsel zu lösen, mit nicht bedrohlichen und bedrohlichen Fahrzeugen umzugehen und jeden Level des Spiels abzuschließen.
