Balloon Match 3D ist ein Match-3-Spiel mit einem Ballon-Thema. Das einzige Ziel des Spielers ist es, jedes Spielfeld von schwebenden Ballons zu befreien, die an einem Geschenk befestigt sind. Der Spieler kann jederzeit bis zu sieben Ballons entfernen, indem er sie auf sieben leere Luftballonfelder am unteren Rand des Spielfelds schickt. Dabei muss er seine Auswahl so koordinieren, dass er die Luftballons nie ganz auffüllt und keine Züge mehr hat.
Das Spiel erlaubt nur das Platzen von drei passenden Ballons, die im Spiel als Spielsteine bezeichnet werden, in den Blasenfeldern. Wenn der Spieler Ballons auswählt, muss er versuchen, drei gleichfarbige Ballons hintereinander auszuwählen, um freie Plätze zu erhalten.
Wenn der Spieler alle Ballons entfernt hat, vergibt das Spiel Sterne als Punkte und einen Sternenbonus, der sich aus den Multiplikatoren für aufeinanderfolgendes Entfernen und der verbleibenden Zeit auf einer Countdown-Uhr ergibt. Nach einer bestimmten Spieldauer belohnt das Spiel den Spieler außerdem mit Schätzen in einer Truhe und neuen Kacheldesigns, wie z.B. Ballons, die Smileys und Länderflaggen zeigen.
Balloon Match 3D hilft dem Spieler, die richtige Auswahl zu treffen und Ballons auf verschiedene Arten zum Platzen zu bringen. Ausgewählte Ballons werden grün umrandet. Es stellt fünf Werkzeuge unterhalb der Luftballonflächen zur Verfügung, darunter ein gelbes Glühbirnen-Werkzeug, das drei übereinstimmende Ballons automatisch entfernt, und einen Rückwärtspfeil, der den letzten Zug rückgängig macht.
Der Spieler kann die Ballons auch drehen, um schneller Übereinstimmungen zu finden, und Booster verwenden, um Ballons zu zerstören. Wenn er scheitert, kann er auch verdiente Münzen verwenden oder sich Werbung ansehen, um fortzufahren, anstatt neu zu beginnen.