I Wonder Crash Clicker har du ett uppdrag att förstöra alla världens underverk som pyramider, hängande trädgårdar och mycket mer. Du gör detta genom att låta det regna ner en ström av projektilblock som förstör blocken som utgör de olika strukturerna som du attackerar. Du börjar med att attackera hus och byar för att bygga upp dina poäng och använder sedan dina poäng för att köpa uppgraderade attacker. Attackerna är följande:
Gul - Din standardattack
Röd - Liten men snabb attack
Lila - Explosiv attack
Grön - Splitterattack
Turkos - Hoppande attack
Rosa - Vertikal linjeattack
Grå - Horisontell linjeattack
Många av attackerna kommer att ske med jämna mellanrum, men du kan påskynda din grundläggande gula attack genom att klicka på skärmen. På så sätt kan du också sikta på den.
När du förstör tillräckligt många block får du möjlighet att göra en Wonder Trial. I denna prövning måste du förstöra ett världsunder inom en viss tidsgräns. Det finns inget straff för att förlora så tveka inte att ge det ett försök om du tror att du kan vinna. När du förstör ett underverk får du en särskild valuta som kallas "talanger". Använd talanger för att låsa upp bonusfunktioner som ökad attackkraft och ökad tid för att förstöra underverk.