Merge Blocks 3D är ett tredimensionellt 2048-pusselspel som erbjuder avslappnande fysikaliska element. Spelarens mål är att slå ihop block tills de skapar ett block som matchar numret på en flagga som flyger på en flaggstång i mitten av en cirkulär, roterande plattform.
Spelaren rullar ett projektilblock mot flaggstången och andra block. När två block matchar varandra, smälter de samman och skapar automatiskt det nya blocket med det högre numret. Om spelaren skapar ett block som matchar flaggan får spelaren mynt och en reklambaserad myntmultiplikator. Kistor fyllda med gratis mynt och andra skatter dyker upp på plattformen under spelets gång och varje gång spelaren stiger i nivå. De får också bonusar för att slutföra kombinationsmanövrar.
Merge Blocks 3D låter spelaren uppgradera temat för blocken för att inkludera andra former som frukter. Det finns också boosters för att göra spelet bättre, inklusive en megafon som skakar plattformen för att rulla in några matchande block i varandra, en magnet som slår ihop matchande block oavsett deras positioner på plattformen och en färgboll som höjer nivån på alla block. Spelaren kan också använda en bomb för att spränga ett block som står i vägen för att slå ihop två block.