Butterfly Kyodai HD is een high-definition versie van het populaire, connect-stijl match spel dat een grote verscheidenheid aan vlindervleugels op een stenen raster bord in het midden van een zwembad van water heeft. Het doel van de speler is om elke vleugel van het bord te verwijderen door ze in paren aan elkaar te koppelen.
Als de speler er niet in slaagt elk paar vleugels te verwijderen voordat de tijd om is, verliest hij het spel. De speler kan alleen vleugels koppelen die naast elkaar liggen aan de binnenkant of de randen van het bord of die niet worden geblokkeerd door niet-matchende vleugels. De eerste geselecteerde vleugel gloeit wit op en pulseert op zijn plaats op het bord voordat de speler hem aan een tweede vleugel koppelt. Als een paar vleugels goed past, schuiven de vleugels in elkaar om een vlinder te vormen.
Butterfly Kyodai HD biedt twee hulpmiddelen die de speler helpen de matches op het bord te vinden. Met de toverstafknop selecteert het spel twee overeenkomende vleugels, markeert ze met groen en laat ze pulseren op hun plek. Met de knop met de dubbele pijl herschikt het spel alle vleugels om de speler meer matchmogelijkheden te bieden.