Shape Shooter 3 ist der nächste spaßige, nostalgische Shooter im Arcade-Stil der Shape Shooter-Spielserie. Der Spieler versucht weiterhin, die Angriffe einer breiten Palette von einzelnen und gruppierten Formen unterschiedlicher Größe, Farbe und Fähigkeiten auf einem schwarz-grauen Gitter-Schlachtfeld zu überleben. Sein Ziel ist es, so viele Punkte wie möglich zu sammeln und so viele Angriffswellen wie möglich zu überstehen.
Der Spieler beginnt im Normal-Modus. Wenn er eine Punktzahl von 10.000 erreicht, kann er einen Mystery (???) Modus freischalten. Sie benutzen ein Sternenjägerschiff, das den Schiffen in Shape Crusher vom gleichen Entwickler ähnelt. Das erste Schiff feuert einfache Projektile ab, verfügt über unbegrenzten Treibstoff und wird durch einen temporären Schild geschützt. Der Spieler steuert das Schiff über das Schlachtfeld. Wenn er eine grüne Form abschießt, erhält er Zugang zu zusätzlichen Fähigkeiten. Er kann auch hellblaue Schildteile aufsammeln, um einen zerbrochenen Schild wiederherzustellen. Dazu benötigt er lediglich die Anzahl der Stücke, die auf einem horizontalen Balken oben in der Mitte des Spielfeldes angezeigt wird.
Mit der Zeit bietet Shape Shooter 3 dem Spieler automatische Upgrades zu neuen Schiffen, die über bessere oder zusätzliche Kanonen und Fähigkeiten verfügen. Die aufgerüsteten Waffen entsprechen in der Regel den temporären Waffen der grünen Shapes und umfassen Bomben, Drohnen, Granaten, Laserstrahlen, rotierende Cutter, Streugeschosse, Schneeflocken-Froststrahlen und Fallen.
Wenn der Spieler genügend Münzen auf dem Schlachtfeld einsammelt und sich die Werbung ansieht, kann er die Münzen verwenden, um Waffen für jedes Schiff zu kaufen und freizuschalten. Außerdem kann er einen Kampf nach einem Absturz fortsetzen.
