Ball Sort Puzzle ist ein Sortierspiel, bei dem der Spieler sein schlussfolgerndes Denken einsetzen muss, um in Hunderten von Levels die richtigen Schritte zum Sortieren von Kugeln nach Farben in Laborreagenzgläser zu finden. Die Reagenzgläser hängen im Vordergrund einer nächtlichen Szene im Freien.
Der Spieler kann nur eine Kugel oder mehrere Kugeln in ein Reagenzglas bringen, das genügend leere Felder und eine farblich passende Kugel hat. Immer wenn sie eine Farbe von Kugeln sortieren, schießt ein Reagenzglas farbiges Konfetti. Wenn sie keinen leeren Platz mehr haben, können sie stecken bleiben. Wenn sie nur noch Kugeln einer Farbe sortieren müssen, sortiert das Spiel die Kugeln automatisch.
Ball Sort Puzzle bietet mehrere Werkzeuge, die dem Spieler helfen, schneller und effizienter zu sortieren. Es bietet eine Rückgängig-Taste, die mit einem Rückwärtspfeil markiert ist, und eine Hinweis-Taste, die mit einer Glühbirne markiert ist. Es bietet dem Spieler auch die Möglichkeit, ein zusätzliches Reagenzglas auf dem Spielfeld zu platzieren, aber der Spieler muss sich eine Werbung ansehen, um das Werkzeug zu benutzen.
Das Spiel hat keinen Timer, aber es erschwert den Sortierprozess auf andere Weise. Während der Spieler in den einzelnen Levels vorankommt, beginnt das Spiel, Kugeln mit leicht unterschiedlichen Schattierungen jeder Farbe zu mischen. Außerdem kann der Spieler die zusätzliche Reagenzglasoption nicht nutzen, wenn er einen Werbeblocker verwendet.