Jelly Quest Mania er et match-3-spil, der foregår på en ø med både varme og kolde temperaturzoner. Som i lignende spil skal spilleren forbinde tre eller flere af den samme type genstande, i dette tilfælde farverige geléer, for at fjerne dem fra brættet. De skal samle et bestemt antal forskellige typer geléer, der vises i øverste højre hjørne af skærmen, såsom blå stjerner, orange cirkler og lilla blomster, før tiden løber ud.
Spillet ændrer brættets form på forskellige niveauer, hvilket betyder, at spilleren måske skal arbejde rundt om huller, hvor der ikke er nogen former knyttet til dem. Det låser også nogle geléer under metalstænger. Når dette sker, kan spilleren ikke flytte eller bruge geléerne, før han låser dem op ved at udføre connect matches omkring dem (dvs. flytte to matchende geléer i position mod den låste). Nogle geléer ændrer også udseende, fordi de vender sig i deres felter på brættet.
Hvis spilleren løber tør for træk, omarrangerer spillet automatisk alle geléformernes positioner. Det giver også til sidst spilleren mulighed for at købe og bruge boostere, f.eks. en hammer, der kun fjerner én gelé ad gangen. Hvis spilleren vinder, modtager han/hun op til tre gyldne stjerner og mønter.
