Ball Blaster är ett skjutspel med inslag av löpning och racing. Spelaren skjuter bollar från en kanon på en hinderbana som hänger i luften och som svänger uppåt på avstånd. Spelaren måste föra vapnet till vänster och höger snabbt nog för att avfyra bollar mot randiga, gröna och röda spräckliga bollar som rullar mot den.
Om bollarna når den horisontella streckade linjen före kanonen förlorar spelaren och måste spela om nivån. Om de förstör bollarna innan dess vinner de.
Oavsett resultatet av den första körningen tjänar spelaren pengar som de kan använda för att uppgradera kanonens eldhastighet och skadegrad. Om pengarna tar slut kan de utföra dessa uppgraderingar genom att titta på annonser. De får också hjälp av spelet på andra sätt.
Ball Blaster glider blå multiplikatorportar över banan med jämna mellanrum. Om spelaren skjuter en boll genom en blå grind multiplicerar de antalet bollar som skjuts upp på banan eller får tillgång till specialkrafter. Om de skjuter genom två multiplikatorgrindar ökar de också antalet kanonkulor en andra gång. Om porten med specialkrafter har en snöflingebooster förvandlas kanonkulan till en våg av snöbollar som fryser en eller flera spruckna kulor. Med det sagt visar spelet också intermittent röda grindar. Spelaren måste försöka skjuta förbi dessa grindar i stället för genom dem.