Bubble Pop Butterfly is een fantasie, vlinder-thema, bubble-popping game met prachtig artwork en rustige muziek. In elk level verwijdert een speler bubbels uit verbonden rijen van gemengde bubbels die van de bovenkant van het speelveld naar beneden glijden. Ze moeten een projectiel in een ringshooter koppelen aan twee of meer verbonden bellen op het veld om de bellen te laten knappen.
De ringshooter bevat twee projectielen. Het toont ook het aantal beschikbare projectielen. De speler gebruikt het volgende projectiel of verwisselt het met het tweede. De ringshooter heeft ook een laserachtige richtlijn. De speler kan de lijn recht op een doelwit richten of op een zijmuur projecteren. Alle bubbels onder de bubbels die ze raken vallen ook en knallen.
Bubble Pop Butterfly helpt de speler door het volledige patroon van bubbels weer te geven aan het begin van een level. Het voorziet de speler ook van boosters en andere bubble-popping tools, waaronder een booster die een groot gebied wegvaagt met één schot, een booster die een laser levert om door bubbels te snijden, een booster die een rij bubbels uitschakelt met elektriciteit en een bubbel die een vuurvlieg loslaat die een willekeurige bubbel laat knappen.
Als de speler het goed doet, knallen de overgebleven projectielen als vuurwerk. Als beloning krijgen ze punten, munten en sterren. Na zoveel levels krijgen ze ook een schatkist met geld of boosters.