Fish Story 3 es otro juego de rompecabezas match-3 de la divertida y emocionante serie Fish Story. En el fondo del océano, entre algas, esponjas, serpientes marinas y tortugas, el jugador empareja tres o más objetos idénticos en tableros nivel a nivel para completar tareas para una sirena llamada Pearl. Normalmente recogen formas de vida marina y objetos y realizan otras acciones. Reciben hasta tres estrellas de logro por nivel y monedas.
El jugador crea poderosas herramientas y recibe potenciadores que le ayudan a terminar más rápido, lo cual es importante porque recibe un número limitado de movimientos. En un tablero, pueden crear explosiones en lÃnea y en cruz y bombas arco iris emparejando más de tres piezas y creando escenarios de emparejamiento únicos. También pueden usar la mecánica de fusión para emparejar dos objetos especiales y crear formas aún más poderosas de eliminar y recoger objetos. Además, en el lado derecho del tablero, reciben potenciadores que les permiten intercambiar o eliminar piezas para crear lÃneas.
Fish Story 3 proporciona al jugador regalos de Pearl y otras recompensas cuando alcanzan niveles especÃficos. Estos obsequios suelen darles monedas y potenciadores extra. Luego pueden usar las monedas para activar y comprar potenciadores.