Jewel Bubbles 3 ist ein 3-Gewinnt-Spiel mit futuristischen Juwelen, die wie klare Blasen aussehen, die mit einer farbigen Flüssigkeit gefüllt sind. Das Spiel folgt den klassischen 3-Gewinnt-Regeln. Der Spieler tauscht zwei Juwelen aus, um Reihen aus drei oder mehr passenden Juwelen zu bilden. Das Spiel entfernt die Reihe vom Spielfeld und neue Steine fallen herunter und gleiten in die offenen Lücken.
Das Spiel bietet 60 Stufen des klassischen Spiels. Außerdem gibt es eine gesperrte Bonus-Spieloption. Der Spieler erhält Punkte und Sterne für gute Leistungen in jedem Level. Er hat nur dann Erfolg, wenn er die ihm gestellten Aufgaben erfüllt. Zum Beispiel muss er eine bestimmte Anzahl gültiger Züge ausführen, um eine bestimmte Anzahl von Punkten zu erhalten, graue Blöcke hinter den Juwelen entfernen oder so viele Juwelen wie möglich vom Spielfeld entfernen, bevor die Zeit einer Sanduhr abläuft.
Jewel Bubbles 3 bietet auch klassische Booster, die im Spiel als Bomben bezeichnet werden. Wenn der Spieler Reihen von vier oder mehr übereinstimmenden Juwelen vervollständigt, erhält er verschiedene Versionen dieser mächtigen Werkzeuge, einschließlich eines Diamantjuwels in einer Blase, der eine Reihe und eine Spalte gleichzeitig auslöscht, eines wirbelnden Zentrums aus Punkten, das ein Rechteck mit sechs oder ein Quadrat mit neun Juwelen auslöscht, und eines Regenbogenwirbels, der alle Juwelen auslöscht, die der Farbe des Juwels entsprechen, mit dem der Spieler sie auf dem Feld austauscht.
Wenn der Spieler sich nicht für einen Zug entscheiden kann, kann er den mit Juwelen beschrifteten Knopf in der unteren linken Ecke benutzen, um eine Übereinstimmung aufzudecken.
