Merge Blocks 3D er et tredimensionelt 2048-puslespil, der byder på afslappende fysik-agtige elementer. Spillerens mål er at sammensmelte blokke, indtil de skaber en blok, der passer til nummeret på et flag, der flyver på en flagstang i midten af en cirkulær, roterende platform.
Spilleren ruller en projektilblok mod flagstangen og andre blokke. Når to blokke passer sammen, smelter de sammen og skaber automatisk den nye blok med det højeste nummer. Hvis spilleren skaber en blok, der matcher flaget, modtager han/hun mønter og en reklamebaseret møntmultiplikator. Kister fyldt med gratis mønter og andre skatte vises på platformen under spillet og hver gang spilleren stiger i niveau. De modtager også bonusser for at fuldføre kombinationsmanøvrer.
Merge Blocks 3D giver spilleren mulighed for at opgradere temaet for blokkene til at omfatte andre former som f.eks. frugter. Der er også boostere til at gøre gameplayet bedre, herunder en megafon, der ryster platformen for at rulle nogle matchende blokke ind i hinanden, en magnet, der samler matchende blokke uanset deres positioner på platformen, og en farvekugle, der hæver niveauet for enhver blok. Spilleren kan også bruge en bombe til at sprænge en blok i luften, som står i vejen for at flette to blokke sammen.
