Cups - Water Sort Puzzle er et afslappet sorteringsspil, der minder om boldsorteringsspil, men med et lille twist. En spiller skal sortere væsker af forskellige farver i flasker og andre beholdere i stedet for bolde på næsten 400 niveauer. Når det lykkes dem at fylde en beholder, popper spillet en byge af konfetti, forsegler beholderen med en prop automatisk og forvandler vandet til en brusende drik.
De forskellige farver af væske flyder oven på hinanden i en beholder uden at blande sig med hinanden. Spilleren sorterer væsken ved at hælde en bestemt farve væske i en tom beholder eller i en beholder, hvor den samme farve flyder øverst. Spilleren låser op for nye niveauer efter hver succes, men spillet udfordrer dem ved at øge antallet af væsker og beholdere, der skal sorteres i drikkevarer. Spillet giver spilleren en håndfuld træk, der kan fortrydes for at gøre det lettere at vinde.
Spilleren optjener mønter over tid, som han/hun bruger til at låse op for tilfældige beholdere i spillets butik. De kan øge det beløb, de tjener, ved at se en reklame for at modtage en belønningsmøntmultiplikator på et flerfarvet spin-hjul.