Super Stacker 2 är ett roligt spel med byggklossar som innehåller geometriska och fysikaliska element. Det kräver att spelaren lyckas stapla antropomorfa former i form av lila lådor, gröna trianglar och gula cirklar, vilket dikteras av unika designutmaningar nivå för nivå. Spelaren kan till exempel behöva bygga ett torn, en skolbuss eller en pyramid.
Spelaren behöver inte vara perfekt när han skapar staplarna. De visas de återstående formerna som finns tillgängliga för att slutföra en stapel i en balk ovanför spelplanen. För att slutföra en stapel korrekt behöver de bara att klossarna står upprätt i minst 10 sekunder. Formerna ler glatt när spelaren vinner nivån. Om någon av figurerna verkar rädd eller upprörd och faller av stapeln under den nedre kanten av skärmen förlorar spelaren och måste börja om från början.
Super Stacker 2 ger spelaren fyra lägen med 10 nivåer (Easy Stacks, Medium Stacks, Tricky Stacks och Hard Stacks). Om spelaren lyckas klara utmaningarna i alla 40 nivåer i dessa lägen får han eller hon tillgång till ett särskilt bonusläge. De kan också skapa och dela med sig av sina egna stackutmaningsnivåer med hjälp av en speciell anpassningsbar stackeditor.
