Mind Controller är ett casual fightingspel som gör det möjligt för en spelare via sin avatar att styra fiendernas tankar i en stridsscen med hjälp av en videospelskontroll. Spelaren måste döda en eller flera fiender per arena för att gå vidare till nästa och låsa upp nya kontrollanter.
Spelet är unikt eftersom avataren inte använder sig av riktiga vapen. Istället använder de kontrollern på samma sätt som de skulle göra med olika videospel. Till exempel kan de använda speciella färdigheter som magi genom kontrollerknappar för att förstöra de röda, arga stickmännen med arga ansikten som befolkar arenorna. De kan släppa meteorer på fienden eller öppna ett svart hål under sina fötter. Andra färdigheter är blixtar, spikbollar och tankekontroll över flera kombattanter.
Spelaren måste rikta sin kontrollers laser så att den pekar mot en fiende för att använda dessa och andra vapen. När de använder kontrollern på rätt sätt blir en eller flera stickmän blå, slutar gå och blir oförmögna att röra sig framåt. Spelaren kan plocka upp dem och släppa dem i vatten eller en spikgrop, kasta dem mot roterande sågblad eller använda någon annan fälla på arenan eller släppa loss en specialförmåga.