Marble Dash är ett match-3-spel där man skjuter kulor med en bana i flipperstil och ett gammalt egyptiskt tema. Kulorna på banan rullar mot en utgång. Spelaren måste skjuta projektilkulor mot dessa kulor för att ta bort dem från banan. Spelet har ett nivåläge och ett oändligt läge. I Nivåer måste spelaren uppnå vissa mål för att låsa upp ytterligare nivåer. Med Endless utforskar spelaren ett mystiskt land och låser upp nya länder som är förseglade med kedjor och lås.
Oavsett läget måste spelaren matcha och koppla ihop tre eller fler av samma kulor (färg- och mönstermatchning). När kulorna försvinner producerar de energi som fyller en kristall i det nedre vänstra hörnet. Energin i en fylld kristall ger spelaren en explosiv sprängkula. Precis som i bubbelskjutare kan spelaren växla mellan två kulor i skjutaren för att välja den som bäst matchar de närmaste kulorna.
I Marble Dash kan spelaren också samla fem nycklar för att öppna en skattkista. När de tittar på annonser får de gratis mynt och priser direkt eller via ett snurrhjul. De kan använda mynten för att förbättra sina start- och rörelsehastigheter och poäng. Spelet har också en mängd hjälpsamma boosters, till exempel en pauskula som tillfälligt stoppar spårkulornas rörelse och en regnbågskula som tar bort vilken färg som helst.
