Marble Puzzle Blast är ett pusselspel med bubblor och flipperstil där bubblorna ersätts med kulor. Till skillnad från klassiska bubbelskjutare som har rader av bubblor högst upp på spelplanen och en pil eller kanonskytt, har det här spelet en slingrande bana som ett tåg med färgglada kulor rullar ner mot en utgång och en regnbågsfärgad fjärilsskytt.
Spelaren tar bort kulor från tåget om projektilen fullbordar en connect-3-linje. Till exempel skjuter spelaren en gul kula mot två eller fler anslutna kulor av samma färg och mönster i mitten av tåget. De gula kulorna försvinner och de kvarvarande kulorna rullar bakåt på spåret.
Om de återstående två halvorna av ett tåg åter ansluts med matchande kulor försvinner även de matchande kulorna från spåret. Efter tre på varandra följande scenarier med självförstörda kulor får spelaren en booster, till exempel en svart bomb som förstör alla kulor i sin radie, en regnbågskula som förstör alla kulor av samma färg eller en eldkula som förstör alla kulor den rör vid.
Med Marble Puzzle Blast kan spelaren också skjuta speciella kulor som innehåller boosters, till exempel en raket som förstör slumpmässiga kulor, en pausknapp som stoppar tåget och en omvänd pil som vänder tågets rörelse. De kan också få en daglig present, gratis startövergångar, extrapoäng för att skjuta lootbags och mynt för att köpa boosters.
