Connect Dots 2 är ett pusselspel som utmanar spelaren att spåra vita linjer mellan blågrå prickar på mönster som flyter fritt framför ett rörligt stjärnfält i tre världar och 16 nivåer per värld. Spelaren kan endast nå nya nivåer och världar genom att låsa upp dem i successiv ordning.
Spelaren måste utföra denna uppgift utan att spåra några linjer som de tidigare spårade mellan prickar. Varje nivå har tids-, nivå- och världsnummer ovanför linjerna och prickarna. Mönstren som visas på fältet skapas med hjälp av en mängd olika former, inklusive rektanglar, kvadrater och trianglar.
Sedan spelaren väljer en punkt ger Connect Dots 2 en gul pil som hjälper spelaren att spåra mot nästa punkt. När de har spårat en sektion blir linjen turkos för att visa vad de har gjort. Om spelaren spårar en sektion oavsiktligt kan de börja om från början genom att zappa allting med en gul laser som visas när de väljer dubbelpil-knappen.