Bubble Pop Butterfly är ett fantasispel med fjärilstema och bubbelpoppande spel med fantastisk konst och lugn musik. I varje nivå tar en spelare bort bubblor från sammanhängande rader av blandade bubblor som glider ner från toppen av spelplanen. De måste matcha en projektil i en ringskjutare till två eller fler anslutna bubblor på fältet för att poppa bubblorna.
Ringskjutaren innehåller två projektiler. Den visar också antalet tillgängliga projektiler. Spelaren använder nästa projektil eller byter den mot den andra projektilen. Ringskjutaren har också en laserliknande målinriktning. Spelaren kan rikta linjen rakt mot ett mål eller projicera den från en sidovägg. Alla bubblor under de bubblor de siktar på faller också och poppar.
Bubble Pop Butterfly hjälper spelaren genom att visa det kompletta mönstret av bubblor i början av en nivå. Den förser också spelaren med boosters och andra verktyg för att spränga bubblor, inklusive en booster som utplånar ett stort område med ett skott, en booster som förser en laser som skär igenom bubblor, en booster som tar ut en rad bubblor med elektricitet och en bubbla som släpper ut en eldfluga som spränger en slumpmässig bubbla.
När spelaren gör bra ifrån sig poppar de återstående projektilerna som fyrverkerier. De får poäng, mynt och stjärnor som belöningar. Efter så många nivåer får de också en skattkista som innehåller pengar eller boosters.
