Bubble Mania Pirates är ett enkelt bubbelskjutningsspel med 30 nivåer som har ett tema som handlar om hav och öar. Spelarens enda mål är att spränga så många bubblor som behövs för att samla ett visst antal guldmynt per nivå.
Spelaren måste skjuta en projektilbubbla mot två eller fler bubblor av samma färg för att ta bort bubblor från spelplanen och nå mynten. De får ett begränsat antal projektiler varje nivå. Liksom många liknande spel använder de sig av en prickad mållinje och en ringskjutare laddad med två projektiler. De kan när som helst byta ut den första projektilen mot den andra för att få den bästa matchningen. När de skjuter exakt får de de matchande bubblorna att spricka. De släpper också alla bubblor och oöppningsbara tunnor och stenar under dem i vattentunnor längst ner på fältet för att generera ytterligare poäng. När spelaren vinner en nivå får de poäng och upp till tre gyllene stjärnor.
Bubble Mania Pirates erbjuder flera ytterligare roliga sätt att poppa bubblor. Spelaren kan skjuta genom frostade bubblor. Spelet har också boosters. Med det sagt kräver det inte att spelaren köper några powerups. Istället distribuerar det boosters i varje nivå, och spelaren samlar in de kraftfulla verktygen när han eller hon poppar bubblor. Förstärkarna inkluderar regnbågsbubblor som matchar vilken bubbelfärg som helst, bombbubblor som exploderar närliggande bubblor, blixtbubblor som utplånar en horisontell linje av bubblor och nyckelbubblor som låser upp kedjor som är lindade runt bubblor.
