Squishy Fruits é um jogo de fusão que partilha semelhanças com os jogos incrementais, de fusão, de atirar bolhas e pop-it. O jogador funde frutos num recipiente estreito de paredes azuis para criar frutos maiores. Ao contrário dos jogos de fusão do Suika, o jogador não funde frutos pequenos para criar outros tipos de frutos maiores. Em vez disso, vai colocando pequenas versões de frutos cortados em cima dos mesmos tipos para criar versões maiores, em balão, com lados moles que acabam por crescer o suficiente para rebentar automaticamente. O objetivo é jogar o máximo de tempo possÃvel para obter a pontuação mais alta sem deixar que nenhuma fruta atinja uma linha horizontal vermelha no topo do recipiente.
O jogador escolhe entre o modo de jogo Normal ou Melhorado. Com o jogo Melhorado, o jogador recebe apenas 10 movimentos de inclinação e um atraso mais curto entre as quedas. Com uma inclinação, o jogo faz deslizar todos os frutos, tais como kiwis, cocos, maçãs, laranjas, mangostões, papaias e melancias, de um lado do contentor para o outro, para ajudar a fazer a fusão automática. Em todas as outras alturas, os frutos rolam, saltam e flutuam, o que também resulta em junções automáticas. Num jogo padrão, o jogador pode ver anúncios para ganhar cinco inclinações adicionais por lado em qualquer altura. Também pode escolher um tipo de fruta para deixar cair ou rebentar para fazer fusões e abrir mais espaço dentro do contentor.
Squishy Fruits mostra uma pré-visualização das próximas três frutas disponÃveis no canto superior esquerdo. Também permite ao jogador guardar um fruto numa área de armazenamento até que uma oportunidade de fusão esteja disponÃvel.
