Bubble Cats Story é um jogo de rebentar bolhas que apresenta aventuras felinas e um tema de salvamento de animais. Os gatos antropomórficos Berry, Belle, Ziggy, Smokey e Rita precisam da ajuda do jogador em centenas de nÃveis. O jogador rebenta bolhas com projécteis para completar tarefas, como salvar gatinhos em bolhas de banho depois de terem sido raptados por um polvo vilão e alimentar gatos adultos com bolachas especiais com bolhas.
O jogador só pode rebentar grupos de três ou mais bolhas idênticas. Em vez de um jogo de tiro tradicional, eles dirigem um personagem para usar bolhas de projéteis mantidas em uma caixa em um dirigÃvel que os gatos usam para voar de nÃvel para nÃvel.
O jogo oferece ao jogador vários métodos para passar de nÃvel mais rapidamente. Podem fazer disparos mais precisos com uma linha de mira pontilhada. Podem mudar os projécteis de bolha. Além disso, podem aceder a power-ups e boosters com a ajuda de outras personagens. Por exemplo, podem alimentar um dos outros com bolachas suficientes para que esse personagem aceda a uma habilidade especial e gere um impulsionador que rebenta um grande número de bolhas misturadas.
Bubble Cats Story recompensa o jogador com pontos, estrelas e moedas. O jogador controla a sua pontuação no canto superior esquerdo. Ganha mais pontos quando rebenta aglomerados extremamente grandes e executa movimentos combinados em que acerta e rebenta vários aglomerados seguidos sem falhar.