Fish Story 3 é outro jogo de puzzle de combinar 3 da divertida e emocionante série Fish Story. Ao longo do fundo do oceano, entre algas, esponjas, cobras marinhas e tartarugas, o jogador combina três ou mais itens idênticos em tabuleiros, nÃvel a nÃvel, para completar tarefas para uma sereia chamada Pearl. Normalmente, os jogadores recolhem formas de vida e objectos marinhos e realizam outras acções. O jogador recebe até três estrelas de conquista por nÃvel e moedas.
O jogador cria ferramentas poderosas e recebe reforços para o ajudar a terminar mais depressa, o que é importante porque tem um número limitado de movimentos. Num tabuleiro, podem criar explosões em linha e em cruz e bombas arco-Ãris, combinando mais de três peças e criando cenários de jogo únicos. Também podem utilizar a mecânica de fusão para emparelhar dois itens especiais e criar formas ainda mais poderosas de remover e recolher itens. Além disso, no lado direito do tabuleiro, recebem boosters que lhes permitem trocar ou remover peças para criar linhas.
Fish Story 3 oferece ao jogador presentes de Pearl e outras recompensas quando ele atinge nÃveis especÃficos. Estes brindes dão-lhes normalmente moedas e reforços extra. O jogador pode então usar as moedas para ativar e comprar reforços.