O Bubble Merge é um jogo de fusão como o 2048 e o Suika que apresenta bolhas em vez de peças, cubos ou frutas. O objetivo do jogador é fundir pares de bolhas antropomórficas iguais ao longo de um caminho evolutivo de um tipo de bolha para outro até criar uma bolha azul e sorridente que usa óculos de sol.
O jogo apresenta um contentor branco com um fundo azul em frente a um fundo azul mais escuro. Ao contrário da maioria destes tipos de jogos, as bolhas não caem do topo do contentor para o fundo. Em vez disso, o jogador liberta uma bolha por baixo de uma linha branca horizontal tracejada na parte inferior e esta flutua até ao topo.
O jogador deve tentar fundir as bolhas alinhando cada uma libertada por baixo de uma bolha correspondente. Quando uma bolha toca na sua correspondente, as duas bolhas fundem-se para formar a próxima bolha maior da série. O jogador pode rever uma chave ou um mapa da evolução utilizando o separador por baixo do campo de pontos, no canto superior direito do ecrã. Pode ver uma pré-visualização da próxima bolha disponÃvel para lançamento na parte superior central.
O Bubble Merge também permite que o jogador selecione uma bolha para liberar. Ao utilizar o separador identificado com a bolha de óculos de sol azul no lado esquerdo do ecrã, o jogador pode controlar a bolha seguinte disponÃvel, assistindo a um vÃdeo publicitário.
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