Space Zoo is een blokpuzzelspel met dieren als polyomino-vormen. De speler moet vallende vormen stapelen tot torenachtige structuren op een zwevend platform in drie uitdagingsmodi (Stapelen, Overleven en Vangst). Als de speler het goed doet, wint hij punten en munten. Met het geld kunnen ze extra dieren kopen.
In de Stapel-stand plaatst de speler zoveel mogelijk dieren voordat de blokken zich lukraak opstapelen en een groene laserlijn kruisen die wordt uitgezonden door twee generatoren boven het platform. In het speltype Overleven stapelen ze vormen totdat ze geen levens meer hebben. In de vangstmodus stapelen ze de dieren snel op voordat een vonkende stof die het scherm van onderaf vult de bovenkant van de stapel bereikt. In alle drie de speltypen verliest de speler punten en levens als de blokken van de zijkant van het platform vallen.
Space Zoo geeft de speler handige hulpmiddelen om blokken te stapelen. Ze kunnen de blokken draaien en in positie schuiven. Het spel toont ook een verticale kolom van licht om de speler te helpen beter te zien tegen de donkere, sterrenachtige achtergrond.
