Football Run is een sportief loopspel met arcade platformer elementen. De speler regisseert de bewegingen van een voetballer avatar die een bal trapt terwijl hij langs verschillende paden in verschillende gebieden rent. De eerste omgeving bevat 20 levels. De speler moet een level succesvol afronden om het volgende level vrij te spelen.
De avatar rent en schopt de bal automatisch. De enige taken van de speler zijn om hem te helpen over en onder obstakels door te springen en vijfhoekige gouden munten en rode voetballen te verzamelen. Als de speler de avatar in aanraking laat komen met harde of puntige obstakels op een pad, moet hij het level opnieuw beginnen. De meest voorkomende vallen zijn muren en spikes. De speler bereikt het einde van een level wanneer hij de avatar door een checkpointzone laat glijden die is gemarkeerd met een gouden vlag.
Football Run beloont de speler met maximaal drie sterren. De speler behoudt ook de munten en rode ballen. Ze kunnen munten gebruiken om hun avatar te upgraden in de winkel en rode voetballen om een run voort te zetten bij een checkpoint in plaats van helemaal opnieuw te beginnen.