Space Zoo es un juego de rompecabezas de bloques que presenta animales en forma de poliominós. El jugador debe apilar las formas que caen en forma de torre sobre una plataforma flotante en tres modos de desafÃo (Apilar, Supervivencia y Atrapar). Cuando el jugador lo hace bien, gana puntos y monedas. Pueden usar el dinero para comprar animales adicionales.
En el modo Apilar, el jugador coloca tantos animales como pueda antes de que los bloques se amontonen desordenadamente y crucen una lÃnea láser verde emitida desde dos generadores situados encima de la plataforma. En el modo Supervivencia, apilan formas hasta que se quedan sin vidas. En el modo Atrapar, apilan los animales rápidamente antes de que una sustancia chispeante que llena la pantalla desde abajo llegue a la parte superior de la pila. En los tres modos, el jugador pierde puntos y vidas cuando los bloques caen por el lado de la plataforma.
Space Zoo proporciona al jugador herramientas útiles para ayudarle a apilar bloques. Pueden girar y deslizar los bloques hasta su posición. El juego también muestra una columna vertical de luz para ayudar al jugador a ver mejor contra el fondo oscuro y estrellado.