The Cool Merge ist ein inkrementelles Spiel mit Verschmelzungselementen, das sich speziell auf die Evolution des Lebens auf der Erde konzentriert. Das Ziel des Spielers ist es, Lebensformen zu verschmelzen, bis sie Menschen aus der jüngeren Geschichte und der modernen Gesellschaft nachbilden und dann weitergehen, um potenzielle Lebensformen der nahen und fernen Zukunft zu schaffen. Sie verdienen auch Münzen durch Click-Tap-Interaktionen mit den Lebensformen und durch die automatische Generierung von Leerlaufgeld für jedes neue Leben.
Im Spiel werden alle Lebensformen als Sapiens bezeichnet, auch die nicht-menschlichen. Der Spieler knackt eiförmige Samen, um Amoeba Sapiens zum Vorschein zu bringen. Sie fusionieren identische Samen, um Scorpion Sapiens zu erschaffen. Im weiteren Verlauf der Verschmelzung entstehen Schafe, Dinosaurier, Faultiere und Gorillas. Sobald diese erste Ära endet, schaltet der Spieler eine neue Ära frei, eine von sechs möglichen Ären, in der es Menschen gibt, darunter Höhlenmenschen, Bauern, Ritter, Prinzessinnen und Narren.
Der Spieler muss zwischen den Epochen wechseln, um einen Punkt zu erreichen, an dem er mit dem verdienten Geld aufhören kann, die Samen der ersten Epoche zu verwenden, und stattdessen Kisten in der aktuellen Epoche ablegen kann, die die aktuellste, am höchsten entwickelte Lebensform dieser Epoche enthalten. Das Öffnen der Kisten ist gleichbedeutend mit dem Knacken von Samen. Der Spieler fusioniert dann einfach passende Menschen.
Die coole Verschmelzung erlaubt es dem Spieler, Booster zu benutzen, indem er sich Werbung ansieht. Sie können Booster einrichten, um mehr Münzen zu generieren, Samen zu verbessern und Ereignisse zu beschleunigen. Sie können auch hohe Geldprämien verdienen, indem sie während spezieller Rennen, bei denen sie einen blauen horizontalen Balken an einem roten vorbeiführen müssen, wiederholt Sapiens auf dem Bildschirm auswählen.
