Girl Surfer 3D er et racerspil, der foregår i tredimensionelle vandparksområder, hvor figurerne svømmer, surfer og bruger vandscootere. En pige på ski trukket bag en jetski har brug for hjælp til at manøvrere i bølgerne. Spilleren guider hende gennem lodret hængende guldmønter for at samle mønterne. De hjælper hende også med at redde andre piger, der sidder fast i vandet, og manøvrere rundt om en række forhindringer.
Alle svømmere, der reddes af spilleren, slutter sig til surferen bag jetski`en for at skabe en pyramide. Spilleren skal derefter hjælpe disse figurer med at udføre hovedopgaverne med at indsamle flere mønter, redde flere piger og forhindre styrt ind i klippeblokke og andre objekter.
Som i lignende racer- og rush-spil, såsom stickman- og pencil rush-spil, har Girl Surfer 3D en multiplikatorbane i slutningen af løbet. Jetski`en kører op ad en rampe og kaster pigerne op i luften og ned ad multiplikatorbanen. Det område, hvor pigerne lander i vandet på banen, ændrer spillerens succesniveau.
Spillet giver også spilleren mulighed for at øge mængden af guldmønter, som de samler og senere bruger til at købe skind, der opgraderer pigens udseende. De skal blot se en reklame. De kan også prøve nye skins ved at se reklamer.