Destroy Base er et skydespil, der fokuserer på militære kampe mod terrorister og gidseltagere fra en helikopter eller et flyperspektiv under forskellige vejr- og kampscenarier. Spilleren eliminerer fjender, ødelægger bygninger og redder gidsler. I dette first-person-shooter med skjult visning vises spillerens avatar og deres våben ikke på skærmen. I stedet er visningen et kameraperspektiv af målområdet på et gitter, der er placeret under den skjulte shooter.
Spilleren får i første omgang en 9 mm pistol. Efter en vellykket mission modtager de penge til at opgradere deres pistol. Opgraderingsmulighederne omfatter en 9 mm Killer Gun, 4,6 mm Rapid - Fire, 5,56 mm Assault Rifle, 5,56 mm M614, 7,62 mm Destroyer, 7,62 mm Exterminator og Null Burning Blaster. De kan tredoble det beløb, de modtager ved afslutningen af en mission med en X3-multiplikator, hvis de ser en reklame.
Destroy Base kræver ikke, at spilleren skal ødelægge hele basen. Spillet viser mål, såsom et bestemt antal fjendtlige soldater eller tilhørende maskiner, som ikoner nær det øverste venstre hjørne. Det giver også forskellige nyttige objekter, herunder røde tønder, som spilleren kan bruge til at sprænge fjenden i luften. En skadesmåler øverst på skærmen viser en rød bjælke for at vise, hvor meget af spillerens helbred der er tilbage i løbet af en specifik mission.
