Stair Run är ett racingspel med klick-tap. Löparen är en superhjälte eller en person som bär en superhjältedräkt som springer på en vit bana med mångfärgade kanter som hänger i en djupblå himmel. Spelaren måste hjälpa löparen att övervinna höga röda geometriska former och andra hinder i deras väg. De måste också uppnå en hög slutpoäng på en regnbågsfärgad trappa i slutet av banan där steg representerar olika poängmultiplikatorer.
Hjälten startar automatiskt loppet i det ögonblick som spelaren interagerar med spelskärmen. De samlar plankor på banan som de kan använda för att skapa steg som stiger upp och över hindren. Spelaren måste styra brädans placering genom att klicka eller trycka på skärmen i tid för att löparen ska kunna ta sig förbi ett hinder.
Spelaren behöver inte fästa brädorna vid något. När löparen når toppen av ett hinder kan spelaren sluta styra placeringen av brädorna. Karaktären flyter helt enkelt ner till banans nivå.
Stair Run kräver att spelaren har utmärkt fingerfärdighet, koordination och timing för att placera brädorna i rätt ögonblick. De måste också ha fantastiska uppskattningsförmåga för att garantera att karaktären har tillräckligt med brädor när den når slutet av banan. Löparen kan inte klättra uppför trapporna. Istället måste spelaren klicka eller trycka upprepade gånger för att placera brädor som hjälper den att nå en multiplikatorzon med högt värde.