Mobile Run är ett tredimensionellt arkadspel där spelaren ska styra en mobiltelefon på ett säkert sätt på en hinderbana som flyter på vatten i 55 nivåer genom att samla in och använda mobilappar. Banan har grindar markerade med app-ikoner och en svartvit ring som fungerar som mållinje. Tävlingsbanan fortsätter bortom målringen med en multiplikatorsektion.
Om spelaren är villig att titta på annonser kan han/hon samla in två slumpmässiga appar innan han/hon börjar springa. Under loppet styr de mobiltelefonen genom en grind. De måste sedan snabbt aktivera en eller flera appar för att ta sig igenom en mängd olika hinder, till exempel spikar på marknivå och roterande sågblad. Spelaren kan inte råka köra telefonen av banan och ner i vattnet. Med det sagt, om de slår telefonen in i något hinder måste de starta om loppet.
Apparna i Mobile Run erbjuder nästan obegränsad kraft. Spelaren kan till exempel styra telefonen att hoppa eller flyta, utlösa explosioner, träffa hinder med blixtar och till och med styra små stickmän för att förstöra hinder.
Spelaren kan också höja sin nivå före en körning om han eller hon är villig att titta på annonser. Reklamalternativet gäller även för att byta telefonens hud från gul till rosa, kamouflage, grått eller en spelkonsol.
