Cartoon Networks Ben 10: Omniball Battles är ett fightingspel med pachinko-liknande stridsmekanik. Spelaren hjälper Ben att bekämpa sin rival Kevin i omniballmatcher. Bens huvudmål är att ta Kevins energi och orsaka skada.
Spelaren måste träffa runda, blå- och röda kulor med hjälp av bollar som skjuts från en kanon. Varje studs av en boll på kulorna eller andra föremål ger träffpoäng. Om en boll faller ner i en korg som rör sig längst ner på skärmen får spelaren tillbaka den utan någon form av straff. Om bollen faller under skärmen förlorar de ett eller flera av objekten, vilket minskar antalet chanser de har att fortsätta att orsaka Kevin skada.
Ben 10: Omniball Battles har också ett ultimat stridsläge med utomjordisk rustning där spelaren kan aktivera Bens Omni-Kix genom att skjuta bollar mot gröna pellets. Rustningen ger Ben en mängd olika förmågor som gör att han kan orsaka skada snabbare, till exempel fyra armar som gör det möjligt för honom att skjuta fyra bollar åt gången eller större kraft som genererar högre träffpoäng.
Självklart utmanar spelet spelaren genom att så småningom aktivera Kevins utomjordiska rustning också. Dessutom får Ben ett begränsat antal bollar i början av matchen.